Gesunder Reis für die Ernährung der Welt

Die Resistenz gegen den bakteriellen Blattbrand (BLB), der durch das pathogene Bakterium Xanthomonas oryzae pv. oryzae (Xoo) verursacht wird, ist in Asien und Afrika eine sehr wertvolle landwirtschaftliche Eigenschaft, da die Krankheit die Reiserträge erheblich reduziert.

Während des Infektionsprozesses injizieren die Xanthomonas-Bakterien virulenzfördernde Proteine, d.h. Transkriptionsaktivator-ähnliche Effektoren (TALEs), in die Reiszellen. Diese bakteriellen Proteine binden an die Reis-DNA und stimulieren die Transkription von Reisgenen, die für Saccharose-Transporter kodieren. Der Export von intrazellulärer Saccharose durch die Saccharose-Transporter von Reis führt zu einer Anfälligkeit für den Erreger. Die präzise Bearbeitung der Reis-DNA-Elemente, die von den pathogenen Bakterien ausgenutzt werden, führt zu einer vollständigen und breiten Resistenz gegen den BLB.

Während meines Postdoc-Studiums möchte ich fortschrittliche biotechnologische Werkzeuge und Ansätze für die Entwicklung von Elitereislinien mit verbesserter Resistenz gegen Xoo und andere Krankheitserreger nutzen. Anstatt sich auf konventionelle transgenabhängige Ansätze zu verlassen, die zur Einschleusung von Transgenfragmenten in das Pflanzengenom führen,  konzentriere ich mich auf die Etablierung einer transgenunabhängigen (transgenfreien) Editierung der von den pathogenen Mikroorganismen genutzten Elemente.

Der Ansatz des transgen-unabhängigen Genome Editing ermöglicht die direkte Einbringung von Editing-Komponenten in Form von vormontierten Ribonukleoprotein-Komplexen (Protein und RNA) in einzelne Reiszellen mit anschließender Regeneration von Pflanzengewebe aus jeder editierten Zelle. Diese Ribonukleoproteinkomplexe werden in einer Reispflanze schnell abgebaut, so dass der Prozess des Genome Editing schnell und zeitlich begrenzt ist.

      

Planter’s Punch

Unter der Rubrik Planter’s Punch wird jeden Monat ein bestimmter Aspekt des CEPLAS-Forschungsprogramms vorgestellt. Alle Beiträge werden von Mitgliedern der Graduiertenschule und des Postdoc-Programms erstellt.

Über den Autor

Kirill Schenstniy ist Postdoktorand in der Gruppe von Prof. Dr. Wolf Frommer am Institut für Molekulare Physiologie (Heinrich-Heine-Universität Düsseldorf). Er ist fasziniert von der Biotechnologie und beschäftigt sich mit der Ausschaltung von Reisanfälligkeitsgenen, um seine Resistenz gegen verschiedene Krankheitserreger zu verbessern. Bevor er zu CEPLAS kam, promovierte er am Zentrum für Molekularbiologie der Pflanzen (Eberhard-Karls-Universität Tübingen), wo er die Funktionsweise so genannter "Executors" untersuchte, einer neuen Klasse von Resistenzproteinen gegen Bakterienbrand in Pfeffer und Reis. In seiner knappen Freizeit kocht er gerne leckeres Essen, reist ans Meer und hört Musik.

Zum Nachlesen

Schenstnyi, K.; Zhang, Z.; Liu, B.; Nakamura, M.; Schepler-Luu, V.; Loo, E. P. I.; Yang, B.; Frommer, W. B. Loss-of-function mutation in the polyamine transporter gene OsLAT5 as a selectable marker for genome editing. bioRxiv 2023doi.org/10.1101/2023.12.12.571390

Buchholzer, M., Frommer, W. B. An increasing number of countries regulate genome editing in crops.New Phytologist 2022. 237(1), 12-15. doi.org/10.1111/nph.18333.

Schepler-Luu, V.; Sciallano, C.; Stiebner, M.; Ji, C.; Boulard, G.; Diallo, A.; Auguy, F.; Char, S. N.; Arra, Y.;Schenstnyi, K.; Buchholzer, M.; Loo, E. P.; Bilaro, A. L.; Lihepanyama, D.; Mkuya, M.; Murori, R.; Oliva, R.; Cunnac, S.; Yang, B.; Szurek, B.; Frommer, W. B. Genome editing of an african elite rice variety confers resistance against endemic and emerging Xanthomonasoryzae pv. oryzaestrains. eLife 2023, 12, e84864. doi.org/10.7554/eLife.84864.

Oliva, R.; Ji, C.; Atienza-Grande, G.; Huguet-Tapia, J. C.; Perez-Quintero, A.; Li, T.; Eom, J.-S.; Li, C.; Nguyen, H.; Liu, B.; Auguy, F.; Sciallano, C.; Luu, V. T.; Dossa, G. S.; Cunnac, S.; Schmidt, S. M.; Slamet-Loedin, I. H.; Vera Cruz, C.; Szurek, B.; Frommer, W. B.; White, F. F.; Yang, B. Broad-spectrum resistance to bacterial blight in rice using genome editing. Nature Biotechnology 2019, 37 (11), 1344–1350. doi.org/10.1038/s41587-019-0267-z

Toda, E.; Koiso, N.; Takebayashi, A.; Ichikawa, M.; Kiba, T.; Osakabe, K.; Osakabe, Y.; Sakakibara, H.; Kato, N; Okamoto, T. An efficient DNA-and selectable-marker-free genome-editing system using zygotes in rice. Nature plants2019. 5(4), 363-368. doi.org/10.1038/s41477-019-0386-z